運輸產業包括道路客運、通勤班車、旅游包車、出租車、校車等傳統客運業務及為適應新市場形勢推出的定制快車、曹操專車、機場專線、醫療直通車、非急救轉運等“互聯網+”業務。其中，主業道路客運現有20多家運輸全資和控股、參股企業，各類營運車輛800余輛，運營班線輻射江蘇省內、山東、安徽、河南、江西等省90余個縣市，承擔著南京70%以上公路長途旅客運輸任務。
南京長運公路運輸有限公司成立于2012年12月，現有職工187人，其中管理人員40人，駕駛人員147人。公司擁有宇通、沃爾沃、安凱、中通等各類中高檔營運客車95輛；營運線路19條，輻射啟東、海門、南通、鹽城、射陽、大豐、徐州、金湖、濱海、阜寧、淮安、揚州、江陰、金壇、常熟等市縣。公司自成立來，一直遵循公車公營經營模式，始終秉持服務至上經營理念，為廣大旅客平安出行提供優質的班線客運服務，南京至常熟、南京至金湖班線榮獲南京市“工人先鋒號”榮譽稱號。公司擁有技術精湛、服務過硬駕駛員隊伍，駕駛員李龍艷、唐杰、顧潔、周忠華等人先后榮獲南京市勞動模范、省市最美交通人、省市技術能手、市“五一”勞動獎章、南京市首屆工匠、300萬公里優秀駕駛員、南京市好市民、全國無償獻血奉獻金獎等榮譽稱號。公司堅持以實際行動踐行國企擔當，先后參加了2013年南京亞青會、2014年南京青奧會、2017年世界輪滑錦標賽和2018年世界羽毛球錦標賽等重大活動賽事交通運輸保障服務。疫情期間，派出團隊支援揚州、南京南站轉運專班，承擔了南京市公衛中心醫務人員通勤班車、海南返寧人員轉運、新疆返寧人員轉運等交通保障任務，受到了政府和社會各界的高度好評。
南京白鷺高速客運股份是專門從事長途客運及旅游運輸的股份制企業，是具有一級道路客運經營資質、省市際旅客班線運輸及省市際旅游包車運輸資格的專業客運企業，現有職工94人，其中管理人員29人，駕駛人員65人，實際運營車輛73輛。公司擁有ISO9001:2015質量體系認證和安全標準化一級資質。經營范圍包括長途客運、旅游包車、商務包車、賽事包車、通勤車等業務。白鷺人憑著誠實守信的經營理念，服務至上的工作作風，獲得了一系列榮譽，涌現了許多先進典型：白鷺品牌于2012年獲得南京市名牌稱號，2015年榮獲江蘇省名牌稱號。公司于2013年榮獲“第二屆亞洲青年運動會交通運輸保障優秀團隊”，2015年榮獲“服務保障南京青奧會立功單位”，公司2016-2018年度、2019-2021年度連續被評為南京市文明單位，2020年被授予全省道路交通運輸行業抗擊新冠疫情優秀集體。駕駛員徐友祥、范本華、童建軍榮獲了市勞動模范、江蘇省市“五一”勞動獎章、省市最美交通人、省市技術能手、2018年度“感動交通”年度人物、南京市好市民、南京好人等榮譽。公司先后為2013年南京亞青會、2014年南京青奧會、國家公祭日、2017世界輪滑錦標賽、2016-2017賽季CBA聯賽、2018年上海合作組織會議、2018年羽毛球世錦賽、2022年馳援上?？挂哚t護人員交通保障等大型賽事活動和重大交通任務提供高效、優質的運輸服務保障，獲得了一致好評。
長客運輸一公司是主要從事省際班線運營和道路接駁運輸專業運輸公司，現有人員159人，其中管理人員36人，駕駛人員123人。擁有宇通、蘇州金龍、安凱等各類營運客車53輛，擁有接駁資質車輛2輛，營運路線40條，輻射蘇、魯、皖、豫等4省30余市。公司駕駛員陸世榮先后被授予江蘇省“五一勞動獎章”、省技術能手、省五一創新能手、南京市銀牌駕駛員等榮譽稱號。
江蘇長運定制客運服務南京有限公司是由江蘇南京長途汽車客運集團有限責任公司和江蘇長運定制客運服務有限公司共同投資組建，成立于2015年11月?，F有管理人員15人，駕駛人員50人，管理車輛107輛，營運車輛56輛，租賃車輛51臺。經營范圍覆蓋：定制班車客運、市區班車、旅游包車、汽車租賃、省市黨政、事業及團體乘用車租賃服務定點采購平臺用車等業務。公司自成立來，參與了世界輪滑賽及世界羽毛球賽、歡樂谷接駁車、長江潮音樂節等重大活動賽事交通運輸保障任務，以優質服務實現了“零投訴”，獲得了社會一致好評。2021年，公司積極參與政府社會化車輛租賃項目投標工作，成功中標江蘇省省級及南京市黨政機關、事業單位及團體組織乘用車租賃服務項目，現為政府社會化車輛租賃項目供應商，為政府部門用車服務提供交通保障。
南京利凱汽車租賃有限公司于2001年6月8日成立，注冊資金1000萬元，是江蘇南京長途汽車客運集團有限責任公司全資子公司。公司現有管理人員8人，在營出租車52輛。經營范圍主要為：汽車租賃、汽車代駕及咨詢服務；汽車、汽車配件銷售、技術服務、技術咨詢；代理汽車過戶、年檢、上牌服務；自有房屋租賃；許可項目：道路貨物運輸（不含危險貨物）；托管寧港汽車運輸有限公司。
南京白鷺快件運輸有限公司是江蘇南京長途汽車客運集團有限責任公司下屬的快件運輸企業。在南京汽車客運站（小紅山站）、南京汽車客運南站設有營業點，依托客運班線營運網絡開展快件業務，業務范圍輻射浙江、安徽、河南、山東、江蘇等省90多個縣市，快遞物品可當日到達，既安全又快捷。
南京長客非急救轉運服務有限公司，是江蘇南京長途汽車客運集團有限責任公司的控股子公司，2018年在南京市委市政府領導關心下，由市衛健委、市交通運輸局、市公安局交通管理局等六部門共同授權批準成立，于當年8月31日正式營運，開通專用服務熱線025-962120，為起點和終點有一端在南京非急救類病人提供合法正規、安全可靠、收費透明的轉運服務。目前在職員工近200人，轉運車輛90臺。服務熱線962120已成為南京公共服務的一張名片。南京非急救962120不僅是市政府民生工程，還是南京城市戰備應急救援保障單位，全程參與了南京市各區新冠防疫轉運工作，得到市政府和市防疫指揮部的嘉獎。
南京長客優行網絡科技有限公司是由南京利凱汽車租賃有限公司、杭州優行科技有限公司共同投資組建。主要負責南京地區“曹操專車”的運營。公司成立于2015年，秉持“低碳致尚、服務至上”的核心價值觀，以新能源汽車為運營主體開展網約專車、出租車、同城快送、低碳商城、曹操碳銀行等業務，致力于為用戶提供更高品質、更多元化的綠色出行服務?！罢f曹操，曹操到”，曹操專車是您出行的最優選擇。