運輸產業包括道路客運、通勤班車、旅游包車、出租車、校車等傳統客運業務及為適應新市場形勢推出的定制快車、曹操專車、機場專線、醫療直通車、非急救轉運等“互聯網+”業務。其中，主業道路客運現有20多家運輸全資和控股、參股企業，各類營運車輛800余輛，運營班線輻射江蘇省內、山東、安徽、河南、江西等省90余個縣市，承擔著南京70%以上公路長途旅客運輸任務。
站務板塊經過整合，組建了南京公路客運站務有限公司，下設南京汽車客運站、汽車客運南站、汽車東站、客運北站、江寧站和葛塘站等6家客運站及南京聯網售票服務中心，管理進站班線300余條，日發客流5萬人次，高峰日發18萬人次。站務公司成立后，打破班線資源在各車站之間的流動瓶頸，根據旅客流量、流向合理調配全市班線資源，便捷更多的旅客出行需求。隨著高鐵南京北站進入十三五計劃，未來江北客運站也將依高鐵站而建，并規劃建設泰馮路客運站。
旅游產業是集團公司轉型發展的主要方向，涵蓋南京市各旅游集散中心、旅行社、線上平臺、旅游運輸以及文化創意等多個方面。在南京汽車客運南站設立了散客旅游服務平臺——南京旅游集散中心；配合旅游集散中心體系，設立了以“鄉村游”業務為主的美在鄉村旅游公司，以“周邊游”業務為主的長客行行旅游公司，以“環城游”業務為主的都市觀光巴士公司，以專注于旅游客運融合信息化平臺服務為主的運游通公司等。
修理板塊由蘇創汽車維修服務有限公司、南京茂昌機動車檢測有限公司組成。下設蘇創、幕府、東站、小車4個修理廠，檢測站、加油站及宇通南京配件中心庫，經營范圍涵蓋汽車服務全產業鏈，包括汽車銷售（客車銷售）、配件供應、大中小型車輛維修、救援、博世柴油系統維修、汽車檢測、二手車交易等。
三產板塊由資產經營公司、長江裝飾城、雄獅電子商城等組成，主要經營范圍包括商城店鋪租賃、物業管理、停車管理、駕駛培訓及土地開發利用，對內履行集團公司后勤保障。長江裝飾城、雄獅電子商城作為區域老牌賣場，在市民心目中有較高的知名度。
溧高板塊由長客集團下屬潤溧公司和寧高公司組成，通過將溧水區和高淳區客運資源、旅游資源、管理資源協調共享，形成區域力量，打通區域瓶頸，促進整體發展。主營業務為道路客運、車輛維修、公交班線、出租車等，同時配合集團公司旅游集散中心體系打造，建立溧水、高淳旅游集散分中心，開發旅游業務；盤活現有資產，積極引進合作伙伴，承接區域校車業務；積極嘗試定制班線、定制包車、機場班線等新型運輸業務。
南京長運公路運輸有限公司成立于2012年12月，現有職工187人，其中管理人員40人，駕駛人員147人。公司擁有宇通、沃爾沃、安凱、中通等各類中高檔營運客車95輛；營運線路19條，輻射啟東、海門、南通、鹽城、射陽、大豐、徐州、金湖、濱海、阜寧、淮安、揚州、江陰、金壇、常熟等市縣。公司自成立來，一直遵循公車公營經營模式，始終秉持服務至上經營理念，為廣大旅客平安出行提供優質的班線客運服務，南京至常熟、南京至金湖班線榮獲南京市“工人先鋒號”榮譽稱號。公司擁有技術精湛、服務過硬駕駛員隊伍，駕駛員李龍艷、唐杰、顧潔、周忠華等人先后榮獲南京市勞動模范、省市最美交通人、省市技術能手、市“五一”勞動獎章、南京市首屆工匠、300萬公里優秀駕駛員、南京市好市民、全國無償獻血奉獻金獎等榮譽稱號。公司堅持以實際行動踐行國企擔當，先后參加了2013年南京亞青會、2014年南京青奧會、2017年世界輪滑錦標賽和2018年世界羽毛球錦標賽等重大活動賽事交通運輸保障服務。疫情期間，派出團隊支援揚州、南京南站轉運專班，承擔了南京市公衛中心醫務人員通勤班車、海南返寧人員轉運、新疆返寧人員轉運等交通保障任務，受到了政府和社會各界的高度好評。
南京白鷺高速客運股份是專門從事長途客運及旅游運輸的股份制企業，是具有一級道路客運經營資質、省市際旅客班線運輸及省市際旅游包車運輸資格的專業客運企業，現有職工94人，其中管理人員29人，駕駛人員65人，實際運營車輛73輛。公司擁有ISO9001:2015質量體系認證和安全標準化一級資質。經營范圍包括長途客運、旅游包車、商務包車、賽事包車、通勤車等業務。白鷺人憑著誠實守信的經營理念，服務至上的工作作風，獲得了一系列榮譽，涌現了許多先進典型：白鷺品牌于2012年獲得南京市名牌稱號，2015年榮獲江蘇省名牌稱號。公司于2013年榮獲“第二屆亞洲青年運動會交通運輸保障優秀團隊”，2015年榮獲“服務保障南京青奧會立功單位”，公司2016-2018年度、2019-2021年度連續被評為南京市文明單位，2020年被授予全省道路交通運輸行業抗擊新冠疫情優秀集體。駕駛員徐友祥、范本華、童建軍榮獲了市勞動模范、江蘇省市“五一”勞動獎章、省市最美交通人、省市技術能手、2018年度“感動交通”年度人物、南京市好市民、南京好人等榮譽。公司先后為2013年南京亞青會、2014年南京青奧會、國家公祭日、2017世界輪滑錦標賽、2016-2017賽季CBA聯賽、2018年上海合作組織會議、2018年羽毛球世錦賽、2022年馳援上?？挂哚t護人員交通保障等大型賽事活動和重大交通任務提供高效、優質的運輸服務保障，獲得了一致好評。